Az Európai Támogatásokat Auditáló Főigazgatóság 2010. július 1-jén jött létre. Feladata meghatározott európai uniós és más nemzetközi támogatások - ennek keretében a vonatkozó közbeszerzési eljárások - második szintű ellenőrzése.
A Főigazgatóság autonóm államigazgatási szerv. A 2022. évi XLIV. törvény tartalmazza a Főigazgatóság jogi státuszára, szervezetére, feladataira és eljárásaira vonatkozó részletes szabályokat.
Szakmai tevékenységében a Főigazgatóság független az irányító hatóságoktól, közreműködő szervezetektől, az igazoló hatóságtól, illetve a kedvezményezettektől. A Főigazgatóság a tevékenységének tervezése során, a módszerek kiválasztásában és a program végrehajtásában önállóan jár el, befolyástól mentesen állítja össze a megállapításokat, következtetéseket és javaslatokat tartalmazó jelentéseket, amelyek tartalmáért felelősséggel tartozik.